Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gtf2bP62915 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf2bP62915 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2bP62915 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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