Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pou3f4P62515 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pou3f4P62515 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pou3f4P62515 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms