Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snrpd3P62320 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snrpd3P62320 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms