Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snrpd1P62315 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snrpd1P62315 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snrpd1P62315 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms