Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmc5P62196 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmc5P62196 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmc5P62196 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms