Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap1s1P61967 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap1s1P61967 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap1s1P61967 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap1s1P61967 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap1s1P61967 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap1s1P61967 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ap1s1P61967 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap1s1P61967 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap1s1P61967 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms