Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copz1P61924 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copz1P61924 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copz1P61924 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copz1P61924 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copz1P61924 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Copz1P61924 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copz1P61924 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Copz1P61924 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Copz1P61924 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copz1P61924 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Copz1P61924 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms