Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sem1P60897 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sem1P60897 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sem1P60897 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sem1P60897 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sem1P60897 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sem1P60897 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sem1P60897 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sem1P60897 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sem1P60897 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sem1P60897 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sem1P60897 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sem1P60897 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms