Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ActbP60710 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ActbP60710 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ActbP60710 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ActbP60710 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ActbP60710 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ActbP60710 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ActbP60710 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ActbP60710 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ActbP60710 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ActbP60710 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ActbP60710 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ActbP60710 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ActbP60710 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ActbP60710 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ActbP60710 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ActbP60710 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ActbP60710 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ActbP60710 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ActbP60710 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ActbP60710 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ActbP60710 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ActbP60710 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ActbP60710 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms