Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Csrnp1P59054 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csrnp1P59054 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Csrnp1P59054 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms