Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtdsplP58465 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtdsplP58465 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms