Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CckbrP56481 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CckbrP56481 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckbrP56481 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckbrP56481 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CckbrP56481 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CckbrP56481 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms