Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp5P56399 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp5P56399 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp5P56399 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp5P56399 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp5P56399 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp5P56399 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp5P56399 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp5P56399 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp5P56399 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms