Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GferP56213 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GferP56213 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GferP56213 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GferP56213 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GferP56213 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GferP56213 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GferP56213 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GferP56213 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GferP56213 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GferP56213 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GferP56213 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GferP56213 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GferP56213 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GferP56213 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GferP56213 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GferP56213 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GferP56213 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GferP56213 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GferP56213 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GferP56213 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GferP56213 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GferP56213 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GferP56213 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GferP56213 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GferP56213 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GferP56213 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GferP56213 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GferP56213 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GferP56213 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GferP56213 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GferP56213 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GferP56213 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GferP56213 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GferP56213 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GferP56213 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GferP56213 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GferP56213 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GferP56213 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GferP56213 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GferP56213 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GferP56213 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GferP56213 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GferP56213 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GferP56213 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GferP56213 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GferP56213 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GferP56213 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GferP56213 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GferP56213 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GferP56213 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GferP56213 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms