Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Aqp4P55088 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Aqp4P55088 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Aqp4P55088 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms