Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CastP51125 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CastP51125 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CastP51125 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CastP51125 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CastP51125 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CastP51125 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CastP51125 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CastP51125 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CastP51125 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CastP51125 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CastP51125 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CastP51125 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CastP51125 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CastP51125 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CastP51125 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CastP51125 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CastP51125 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CastP51125 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CastP51125 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CastP51125 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CastP51125 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CastP51125 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CastP51125 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CastP51125 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CastP51125 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CastP51125 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CastP51125 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CastP51125 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CastP51125 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CastP51125 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CastP51125 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CastP51125 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CastP51125 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CastP51125 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CastP51125 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CastP51125 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CastP51125 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CastP51125 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CastP51125 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CastP51125 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CastP51125 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CastP51125 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CastP51125 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CastP51125 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CastP51125 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CastP51125 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CastP51125 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CastP51125 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CastP51125 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CastP51125 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CastP51125 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CastP51125 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CastP51125 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CastP51125 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CastP51125 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CastP51125 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CastP51125 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms