Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa6P50704 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa6P50704 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa6P50704 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa6P50704 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa6P50704 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa6P50704 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Defa6P50704 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa6P50704 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa6P50704 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa6P50704 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Defa6P50704 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa6P50704 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa6P50704 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa6P50704 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa6P50704 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa6P50704 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa6P50704 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Defa6P50704 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa6P50704 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms