Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcl5P50228 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcl5P50228 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms