Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkn1cP49919 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkn1cP49919 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkn1cP49919 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms