Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Chrna7P49582 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chrna7P49582 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms