Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcd1P48410 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcd1P48410 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abcd1P48410 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms