Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ItgavP43406 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgavP43406 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgavP43406 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgavP43406 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ItgavP43406 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgavP43406 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.1 ms