Protein–RNA interactions for Protein: P43267

Sox15, Protein SOX-15, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox15P43267 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox15P43267 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox15P43267 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox15P43267 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox15P43267 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox15P43267 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox15P43267 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sox15P43267 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox15P43267 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox15P43267 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox15P43267 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox15P43267 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox15P43267 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox15P43267 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox15P43267 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox15P43267 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox15P43267 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox15P43267 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox15P43267 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox15P43267 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms