Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LifrP42703 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LifrP42703 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LifrP42703 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LifrP42703 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LifrP42703 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LifrP42703 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LifrP42703 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LifrP42703 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LifrP42703 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LifrP42703 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LifrP42703 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LifrP42703 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LifrP42703 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LifrP42703 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LifrP42703 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LifrP42703 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LifrP42703 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LifrP42703 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LifrP42703 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LifrP42703 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LifrP42703 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LifrP42703 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LifrP42703 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LifrP42703 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LifrP42703 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LifrP42703 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LifrP42703 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LifrP42703 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LifrP42703 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LifrP42703 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LifrP42703 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LifrP42703 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LifrP42703 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LifrP42703 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LifrP42703 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LifrP42703 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LifrP42703 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LifrP42703 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LifrP42703 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LifrP42703 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LifrP42703 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LifrP42703 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LifrP42703 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LifrP42703 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LifrP42703 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LifrP42703 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LifrP42703 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LifrP42703 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LifrP42703 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LifrP42703 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LifrP42703 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LifrP42703 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LifrP42703 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LifrP42703 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LifrP42703 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LifrP42703 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LifrP42703 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms