Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx1-2P42580 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nkx1-2P42580 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nkx1-2P42580 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms