Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv1P41164 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv1P41164 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Etv1P41164 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Etv1P41164 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms