Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ercc5P35689 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ercc5P35689 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms