Protein–RNA interactions for Protein: P35492

Hal, Histidine ammonia-lyase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HalP35492 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HalP35492 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HalP35492 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HalP35492 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HalP35492 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HalP35492 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HalP35492 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HalP35492 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HalP35492 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HalP35492 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HalP35492 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HalP35492 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HalP35492 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HalP35492 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HalP35492 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HalP35492 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HalP35492 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HalP35492 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HalP35492 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HalP35492 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HalP35492 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HalP35492 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HalP35492 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HalP35492 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HalP35492 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HalP35492 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HalP35492 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HalP35492 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HalP35492 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HalP35492 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HalP35492 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HalP35492 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HalP35492 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HalP35492 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HalP35492 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HalP35492 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HalP35492 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HalP35492 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HalP35492 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HalP35492 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HalP35492 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HalP35492 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HalP35492 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HalP35492 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HalP35492 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HalP35492 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HalP35492 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HalP35492 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HalP35492 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HalP35492 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HalP35492 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms