Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifnar1P33896 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifnar1P33896 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms