Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scp2P32020 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scp2P32020 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scp2P32020 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scp2P32020 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scp2P32020 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scp2P32020 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scp2P32020 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scp2P32020 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scp2P32020 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scp2P32020 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scp2P32020 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms