Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PrkcdP28867 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PrkcdP28867 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PrkcdP28867 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms