Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IppP28575 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IppP28575 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IppP28575 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IppP28575 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IppP28575 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IppP28575 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IppP28575 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IppP28575 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IppP28575 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IppP28575 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IppP28575 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IppP28575 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IppP28575 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IppP28575 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IppP28575 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IppP28575 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IppP28575 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IppP28575 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IppP28575 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IppP28575 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IppP28575 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IppP28575 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IppP28575 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IppP28575 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IppP28575 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IppP28575 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IppP28575 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IppP28575 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IppP28575 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IppP28575 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IppP28575 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IppP28575 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IppP28575 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IppP28575 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IppP28575 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IppP28575 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IppP28575 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IppP28575 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IppP28575 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IppP28575 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IppP28575 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IppP28575 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IppP28575 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IppP28575 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IppP28575 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IppP28575 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IppP28575 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IppP28575 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IppP28575 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IppP28575 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IppP28575 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IppP28575 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IppP28575 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IppP28575 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IppP28575 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IppP28575 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IppP28575 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IppP28575 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IppP28575 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IppP28575 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IppP28575 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IppP28575 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IppP28575 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IppP28575 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IppP28575 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
IppP28575 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IppP28575 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms