Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd9P28357 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd9P28357 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms