Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-DMaP28078 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-DMaP28078 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms