Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccl6P27784 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl6P27784 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms