Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NdnP25233 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NdnP25233 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NdnP25233 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NdnP25233 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdnP25233 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NdnP25233 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NdnP25233 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NdnP25233 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdnP25233 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NdnP25233 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NdnP25233 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NdnP25233 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NdnP25233 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NdnP25233 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NdnP25233 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NdnP25233 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NdnP25233 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NdnP25233 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms