Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata3P23772 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata3P23772 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gata3P23772 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata3P23772 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms