Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6bP23440 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6bP23440 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6bP23440 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6bP23440 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6bP23440 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6bP23440 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6bP23440 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6bP23440 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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