Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja1P23242 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja1P23242 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja1P23242 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja1P23242 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja1P23242 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja1P23242 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gja1P23242 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gja1P23242 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms