Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VimP20152 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VimP20152 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VimP20152 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VimP20152 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VimP20152 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VimP20152 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VimP20152 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VimP20152 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VimP20152 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VimP20152 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VimP20152 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VimP20152 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VimP20152 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VimP20152 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VimP20152 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VimP20152 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VimP20152 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VimP20152 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VimP20152 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VimP20152 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VimP20152 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VimP20152 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VimP20152 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VimP20152 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VimP20152 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VimP20152 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VimP20152 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VimP20152 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VimP20152 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VimP20152 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VimP20152 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VimP20152 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VimP20152 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VimP20152 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VimP20152 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VimP20152 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VimP20152 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VimP20152 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VimP20152 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VimP20152 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VimP20152 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VimP20152 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VimP20152 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VimP20152 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VimP20152 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VimP20152 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VimP20152 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VimP20152 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VimP20152 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VimP20152 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms