Protein–RNA interactions for Protein: P19473

Trap1a, Tumor rejection antigen P815A, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trap1aP19473 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trap1aP19473 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trap1aP19473 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms