Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ms4a1P19437 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a1P19437 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ms4a1P19437 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 490.9 ms