Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RargP18911 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RargP18911 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RargP18911 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RargP18911 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RargP18911 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RargP18911 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RargP18911 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RargP18911 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RargP18911 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RargP18911 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RargP18911 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RargP18911 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RargP18911 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RargP18911 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RargP18911 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RargP18911 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RargP18911 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RargP18911 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RargP18911 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RargP18911 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RargP18911 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RargP18911 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RargP18911 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RargP18911 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RargP18911 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RargP18911 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RargP18911 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RargP18911 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RargP18911 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RargP18911 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RargP18911 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RargP18911 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RargP18911 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RargP18911 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RargP18911 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RargP18911 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RargP18911 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RargP18911 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RargP18911 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RargP18911 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RargP18911 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RargP18911 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RargP18911 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RargP18911 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RargP18911 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RargP18911 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RargP18911 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms