Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P18530 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P18530 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18530 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18530 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18530 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18530 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18530 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18530 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18530 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18530 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P18530 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P18530 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18530 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18530 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18530 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18530 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P18530 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18530 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18530 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18530 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P18530 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P18530 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P18530 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P18530 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P18530 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P18530 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18530 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18530 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18530 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18530 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18530 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18530 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18530 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18530 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18530 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P18530 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18530 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18530 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18530 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18530 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18530 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18530 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18530 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18530 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P18530 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P18530 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P18530 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms