Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxb1P17919 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxb1P17919 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms