Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcna1P16388 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kcna1P16388 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kcna1P16388 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms