Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cxcl1P12850 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cxcl1P12850 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms