Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spp1P10923 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spp1P10923 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spp1P10923 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spp1P10923 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spp1P10923 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Spp1P10923 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spp1P10923 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms