Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl2P10889 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl2P10889 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms