Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccl3P10855 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl3P10855 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms